Согласно абз. 2 п. 1 и п. 3 ст. 168 НК РФ налогоплательщик обязан предъявить покупателю товаров (работ, услуг), имущественных прав сумму налога, исчисленную расчетным методом (с применением налоговой ставки 10/110 или 18/118) в порядке, установленном п. 4 ст. 164 НК РФ, и выставить счет-фактуру не позднее пяти календарных дней, считая со дня получения сумм оплаты, частичной оплаты в счет предстоящих поставок товаров (выполнения работ, оказания услуг), передачи имущественных прав.
В соответствии с п. 12 ст. 171, п. 9 ст. 172 НК РФ при соблюдении обязательных условий покупатель вправе принять к вычету предъявленный продавцом НДС.
Согласно пп. 3 п. 3 ст. 170 НК РФ суммы НДС, принятые к вычету в отношении оплаты, частичной оплаты в счет предстоящих поставок товаров (выполнения работ, оказания услуг), передачи имущественных прав, подлежат восстановлению в размере НДС, принятого налогоплательщиком к вычету .
С 01.01.2019 налоговая ставка НДС, предусмотренная п. 3 ст. 164 НК РФ, повышается с 18 до 20%. В связи с этим операции, которые ранее облагались по ставке 18%, с 01.01.2019 облагаются по ставке 20% (пп. "в" п. 3 ст. 1, п. 4 ст. 5 Федерального закона от 03.08.2018 N 303-ФЗ "О внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации о налогах и сборах").
При реализации в 2019 г. товаров (работ, услуг) применяется ставка 20%, даже если ранее с аванса был исчислен НДС исходя из ставки 18/118 (Письмо Минфина России от 06.08.2018 N 03-07-05/55290). К вычету можно принять только фактически исчисленный налог, то есть нужно исходить из прежней ставки.
Переходных положений и исключений в связи с увеличением ставки НДС с 18 до 20% в отношении реализаций товаров (работ, услуг) по договорам, заключенным до 2019 г., не предусмотрено.
Таким образом, суммы НДС, ранее принятые к вычету в 2018 г. в отношении предоплаты в счет предстоящего оказания услуг, восстанавливаются в 2019 г. в размере принятого к вычету НДС по оказанной услуге, в оплату которой засчитывается соответствующая предоплата, исходя из прежней ставки налога. Если в 2018 г. принимался к вычету НДС с выданного аванса по ставке 18/118, то в 2019 г. его необходимо восстановить по той же ставке.