Нужно сдавать 6-НДФЛ за каждое подразделение. Это правило действует, даже если компания и подразделение состоят на учете в одной инспекции. Если компания составит один расчет, то за несдачу второго инспекторы оштрафуют минимум на 1000 рублей (п. 1.2 ст. 126 НК РФ).