Если продавец применил не ту ставку НДС, выставленный им счет-фактура не даст покупателю права на вычет НДС (письмо Минфина от 02.08.2019 № 03-07-11/58375).
О том, что счет-фактура с неправильной ставкой не соответствует требованиям подпунктов 10 и 11 пункта 5 статьи 169 НК и потому не может быть основанием для вычета НДС, Минфин говорил в письмах от 05.02.2019 № 03-07-08/6650, от 25.04.2011 № 03-07-08/124, от 12.04.2007 № 03-07-08/76.