Компания вправе учесть при расчете налога на прибыль страховые взносы независимо от того, на какие выплаты они были начислены (письмо Минфина от 05.02.2018 № 03-03-06/1/6290).
Для налога на прибыль расходами признаются экономически оправданные и документально подтвержденные затраты (п. 1 ст. 252 НК РФ). Перечень расходов, которые не уменьшают налогооблагаемую прибыль, приведен в статье 270 НК РФ. В нем нет страховых взносов с выплат физлицам, не учитываемых в расходах.

Поэтому даже если взносы начислили на выплаты, которые нельзя отнести на расходы по налогу на прибыль, компания вправе учесть их в составе прочих затрат.