Реализация услуг по перевозке пассажиров пригородными электричками с 1 января 2015 года по 31 декабря 2016 года облагается НДС по ставке 0 процентов
Налоговую базу по НДС следует определять как стоимость проездных документов, реализованных в истекшем налоговом периоде.
Для подтверждения обоснованности применения налоговой ставки 0 процентов и налоговых вычетов в налоговые органы необходимо представить отчет о доходах от перевозок пассажиров железнодорожным транспортом в пригородном сообщении.
Письмо ФНС России от 07.09.2015 N ГД-4-3/15648@
"О налоге на добавленную стоимость"