НДС плательщики этого налога определяют на дату отгрузки товара, а также при поступлении аванса. А доходы при УСН компании и ИП определяют на дату поступления денег (п. 1 ст. 346.17 НК). Поэтому если вы отгрузите товары в одном квартале, а оплату получите в следующие, доходы для НДС и налога по УСН не будут совпадать.