Счет-фактуру по приобретенным товарам экспортер регистрирует в книге покупок под кодом 01
Данный код отражается в графе 2 книги покупок, поскольку нет отдельного кода для операций по приобретению товаров, работ, услуг, которые использовались при производстве или реализации товаров, облагаемых НДС по нулевой ставке. Это правило применимо и при экспорте товаров в страны ЕАЭС.
Письмо ФНС России от 26.06.2015 N ГД-4-3/11145@